FAIR4Health Data Curation and Validation Tool

zuletzt aktualisiert
22.12.2023

Themen

Sekundärnutzung klinischer Daten
Metadaten und Metadata Repositories

Projektphase

Durchführung & Betrieb

Auf dieser Seite

Das Data Curation Tool ermöglicht das Hochladen von Daten aus CSV, Excel-Dateien oder einer PostgreSQL Datenbank in einen FHIR-Endpoint. Das Tool bietet eine intuitive grafische Oberfläche, mit der die Daten auf beliebige FHIR-Profile des Endpoints gemappt werden können.

English:
The Data Curation Tool allows data to be uploaded from CSV, Excel files or a PostgreSQL database to a FHIR endpoint. The tool provides an intuitive graphical interface that allows the data to be mapped to any FHIR profile on the endpoint.

Produktdetails

Datum der Erstverfügbarkeit
Version/Versionsdatum
1.2.7
Lizenzmodell
Apache-2.0 license
Preis
kostenlos
Support
Community
Technische Voraussetzungen
FHIR-Server
Release v1.2.7 (Windows)
Apache License 2.0
GitHub Page

Beschreibung

Sollen Daten aus CSV, Excel oder auch aus PostgreSQL-Datenbanken zu einem FHIR-Profile gemappt werden, kann das Data Curation Tool verwendet werden. Voraussetzung dafür ist ein FHIR-Server, auf dem die gewünschten FHIR-Profile verfügbar sind.

Das Data Curation Tool bietet eine grafische Oberfläche, in die Daten zu den FHIR-Profilen gemappt werden. Dabei erfordert das Erstellen der Mappings genau Kenntnisse der FHIR-Profile. Das Tool unterstützt auch komplexere Mappings zwischen verschiedenen Value Sets, wenn diese in einem Terminologie-Server bereitgestellt werden. Die erstellten Mappings können gespeichert und exportiert werden.

Nach Erstellung oder Import eines Mappings werden alle erstellten FHIR-Ressourcen gegen die Zielprofile validiert. Anschließend ermöglicht das Tool einen direkten Upload auf den FHIR-Server oder alternativ den Export von FHIR-Bundels.

Das Produkt im Einsatz

Das Data Curation Tool entstand im Rahmen des von der Europäischen Union geförderten Horizon 2020 Projektes FAIR4Health. Mithilfe des Data Privacy Tool, des Data Curation Tool sowie der dazu gehörende FAIR4Health Plattform wurden zwei klinische Studien durchgeführt:

Für diese Studien wurden die eigens erstellten FAIR4Health FHIR-Profile sowie onFHIR Server verwendet.

Unterstützung

Handbuch

 Für das Data Curation Tool wurde ein Handbuch veröffentlicht.

Workshop

Zu der DMEA - Satellitenveranstaltung 2022 von GMDS und BVMI wurde ein Workshop zu den FAIR4Health Tools abgehalten. Die GitHub Seite des Workshops enthält Anleitungen mit Demodaten für das Data Privacy Tool und das Data Curation Tool.

YouTube

Im Rahmen des Final Assembly wurden das Data Privacy Tool, das Data Curation Tool sowie die dazu gehörende FAIR4Health Plattform ausführlich vorgestellt.

Erfahrungsberichte

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Weitere Merkmale

This project has received funding from the European Union's Horizon 2020 research and innovation programme under grant agreement No 824666

Schlagworte

Kommentare

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