Wenn die Mittel zur Durchführung des medizinischen Forschungsvorhabens bewilligt sind, wird es konkret. Vom Aufbau der Organisationsstruktur über die Einbindung von Studienzentren und die Klärung der Datenflüsse im Einklang mit dem geltenden Datenschutzrecht und ethischen Vorgaben bis zur frühzeitigen Planung der Nachhaltigkeit von Infrastrukturen, die im Rahmen des Projektes aufgebaut werden, von Verträgen über Mitarbeitergewinnung bis zur Stakeholderkommunikation müssen zahlreiche Aufgabenkomplexe zugleich geplant und auf den Weg gebracht werden. Erfahrungsgemäß dauert diese Phase häufig länger als ursprünglich geplant, da viel mehr Aspekte zu berücksichtigen sind als vorhergesehen wurde.
Generische Konzepte, Leitfäden und IT-Werkzeuge sowie der Erfahrungsaustausch mit und die Beratung durch andere Forscher, die ähnliche Vorhaben betreiben, können die Arbeit in dieser Zeit deutlich erleichtern und vor allem beschleunigen.