KNIME Analytics Platform

KNIME

Klinische Studien, Register und Kohorten, Erhebung, Management und Verarbeitung digitaler Bilder, Biobanken, Molekulare Hochdurchsatz-Analysen, Sekundärnutzung klinischer Daten, Forschungsdatenmanagement, Metadaten und Metadata Repositories

Betriebssystem-unabhängig einsetzbare Entwicklungsumgebung für Datenworkflows. English: Development environment for data workflows independent from operating systems.

MIRACUM-Pipe

Institut für Medizinische Bioinformatik und Systemmedizin - Universitätsklinikum Freiburg

Molekulare Hochdurchsatz-Analysen

NGS- und tNGS-Pipeline, einschließlich fortschrittlicher Funktionen zur Variantenannotation und automatischer PDF-Berichterstellung. English: NGS and tNGS pipeline, including advanced variant…

Data Information System - DAISY

ELIXIR Luxembourg

The GDPR is bringing data protection to center stage in research data management, necessitating dedicated tools, personnel, and processes. Our tool, DAISY, is tailored specifically for biomedical…

MTB-cBioPortal

PM4Onco Konsortium

Molekulare Hochdurchsatz-Analysen

Im Rahmen der Arbeiten der Konsortien MIRACUM, BZKF und PM4Onco wurde und wird die Forschungsplattform cBioPortal in Richtung einer Plattform zur Unterstützung des Molekularen Tumorboards weiter…

OntoPortal

Stanford Center for Biomedical Informatics Research (BMIR)

OntoPortal ist eine Ontologie- bzw. Terminologieserversoftware. Sie ist das Produkt hinter BioPortal, wird aber inzwischen für verschiedene Portale wie AgroPortal, EcoPortal, MedPortal und MatPortal…

Bioportal

National Center for Biomedical Ontology

Klinische Studien, Biobanken, Molekulare Hochdurchsatz-Analysen, Sekundärnutzung klinischer Daten, Forschungsdatenmanagement, Metadaten und Metadata Repositories

Bioportal ist einerseits ein Repository für medizinische Terminologien und Ontologien und bietet andererseits Programmierschnittstellen für den Zugriff darauf. English: Bioportal is a repository…

3LGM²-Baukasten

Institut für Medizinische Informatik, Statistik und Epidemiologie (IMISE), Universität Leipzig

3LGM² Tool (3LGM²-Baukasten) ist eine Software zur Unterstützung der Modellierung von Informationssystemen im Gesundheitswesen beim strategischen und taktischen Informationsmanagement. English: …

menoci.io - lightweight data management for biomedical research

Department of Medical Informatics, University Medical Center Göttingen

Erhebung, Management und Verarbeitung digitaler Bilder, Molekulare Hochdurchsatz-Analysen, Forschungsdatenmanagement, Metadaten und Metadata Repositories

menoci is a collection of open source Drupal extension modules that can be used to rapidly deploy an integrated website and data management portal for research projects in the biomedical and life…

CentraXX

KAIROS GmbH

Klinische Studien, Register und Kohorten, Biobanken, Molekulare Hochdurchsatz-Analysen, Mobile IT-Werkzeuge, Sekundärnutzung klinischer Daten, Forschungsdatenmanagement, Metadaten und Metadata Repositories, Datenschutz, Cloud-Computing

Biomedizinisches Forschungsportal für die personalisierte Medizin mit Schwerpunkt auf der strukturierten Erfassung von Forschungsinhalten und die Systemintegration klinischer Daten. English: …

PRIMAT - PRIvate MAtching Toolbox

Abteilung Datenbanken, Universität Leipzig

PRIMAT ist eine quelloffene (ALv2) Toolbox für die Definition und Ausführung von PPRL-Workflows. Sie bietet mehrere Komponenten für Dateneigentümer und die zentrale Linkage Unit, welche modernste…

Molekulare Hochdurchsatz-Analysen

Molekularbiologische Methoden und Hochdurchsatz-Technologien haben in den letzten Jahren eine rasante Entwicklung erlebt. Es ist heute möglich, Biomoleküle einer Zelle mit vertretbarem zeitlichen und…

FAIRDOM-SEEK

HITS gGmbH - Heidelberger Institut für Theoretische Studien

Klinische Studien, Register und Kohorten, Molekulare Hochdurchsatz-Analysen, Sekundärnutzung klinischer Daten, Forschungsdatenmanagement, Metadaten und Metadata Repositories, Cloud-Computing

SEEK ist eine Open Source-Software zum Datenmanagement unterschiedlicher wissenschaftlicher Daten. English: SEEK is an open source software for the data management of different scientific data.

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